Biopankkiaineisto
Ainutlaatuinen aineisto mahdollistaa korkealaatuista tutkimusta! Veripalvelun biopankkiin kerätään biopankkiin liittyneiden verenluovuttajien näytteitä ja tietoja verenluovutuksen yhteydessä.
Miksi valita meidät?
Veripalvelun laatujärjestelmä ja ammattitaitoinen henkilökuntamme varmistaa näytteidemme korkean laadun. Tavoitteenamme on jatkuvasti kehittää palveluitamme.
Kasvava kokoelmamme kerätään verenluovutuskelpoisilta henkilöiltä koko Suomen alueelta. Aineistoomme sisältyy mm. pitkittäisnäytteitä, erityiskokoelmia sekä genomitietoa.
Tutkimustarpeen mukaisesti voimme tarvittaessa toteuttaa räätälöityjä näytekeräyksiä tai toimittaa aineistoa esimerkiksi feno- tai genotyypin perusteella. Voimme toimittaa näytteitä tuoreena tai pakastettuna. Aineistoa on mahdollista hakea tutkimuskäyttöön tietyn kriteerin, esimerkiksi terveystiedon tai demografisen tiedon perusteella. Aineisto soveltuu hyvin käytettäväksi myös verrokkiaineistona.
Valmiiksi kerätyt näytteet
Valmiina olevien näytteiden osalta näytteiden valikoinnissa voidaan ottaa huomioon esimerkiksi näytteenantajan geno- tai fenotyyppi soveltuvin osin. Kaikista näytteistä on saatavilla aikaleimat keräyksestä, käsittelystä ja pakastuksesta. Näytteet on kerätty verenluovutuksen yhteydessä biopankkiin liittyneiltä verenluovutuskriteerit täyttäviltä henkilöiltä.
Istukkaverikokoelma
SPR Veripalvelu keräsi vuosina 1999–2013 suostumuksen antaneilta vastasynnyttäneiltä äideiltä istukkaverta Istukkaveripankkiin (IVP). Näytteet on siirretty Veripalvelun biopankkiin erillisellä suostumusmenettelyllä vuonna 2023.
Istukkaverivalmiste on istukasta lapsen syntymän yhteydessä kerättyä verta. Istukkaveriyksiköstä on otettu valmistuksen aikana näytteitä mahdollisia myöhemmin tehtäviä lisätutkimuksia varten. Myös äidistä on arkistoituna verinäytteitä (plasmaa, seerumia ja valkosoluja) mahdollisia lisätutkimuksia varten.
Näytteet täyttävät kaikki kliinisen valmisteen vaatimat mittaukset. Näytteet säilytetään -180°C nestetyppipakastimessa.
Istukkaveren kantasoluvalmiste
197 luovuttajaa.
Verivalmistenäytetyypit: Plasma (natiivi), Plasma (20% HES), Elävät solut (10% DMSO), DNA.
Arkistonäytetyypit (äitinäytteet): Plasma, Seerumi, Buffy Coat.
Näytteisiin liittyvä data-aineisto
Istukkaverivalmisteen prosessoinnin aikaleimatiedot, veriryhmätiedot, solumäärät, kudostyyppi (mm. HLA-A, -B, -C, -DRB1), raskauskertomus, perusverenkuva.
Näytekeräys tutkimustarpeen mukaan
Näytteitä voidaan kerätä myös räätälöidysti tutkimustarpeen mukaan esimerkiksi geno- tai fenotyypin perusteella. Näytekeräys voidaan toteuttaa esimerkiksi tietyllä Suomen alueella, tietystä ikäryhmästä, tai muun kriteerin perusteella. Kerättävät näytteet ovat verta tai veren osia, esimerkiksi tuore tai pakastettu kokoveri ja buffy coat. Näytteitä kerätään ainoastaan biopankkiin liittyneiltä verenluovuttajilta.
Kokoverinäyte
Näyte kerätään verenluovutuksen yhteydessä verenluovutuskriteerit täyttäviltä henkilöiltä. Näyte kerätään lähtökohtaisesti 4–10 ml EDTA-putkeen, mutta näyte voidaan kerätä tarvittaessa myös muunlaiseen näytteenottoputkeen (esim. Litium-Hepariini, Cell-Free DNA BCT). Näytteen kokonaistilavuus yhdeltä henkilöltä on enintään 12 ml. Näytteet voidaan toimittaa tuoreina tai pakastettuina.
Buffy Coat
Näyte kerätään verenluovutuksen yhteydessä verenluovutuskriteerit täyttäviltä henkilöiltä. Buffy Coat on luovutetun sentrifugoidun veren valkosolu-verihiutaleosuus, joka sisältää lisäksi pienen määrän plasmaa ja punasoluja. Näyte toimitetaan seuraavana päivänä verenluovutuksesta. Yhden Buffy Coatin kokonaistilavuus on 40–50 ml (40- 50 g).
Näytteenantajat
Voimassa oleva biopankkisuostumus ja -hyväksyntä biopankissa, suostumus kutsua osallistumaan uuteen tutkimukseen (recall). Luvut suuntaa antavia, luvut päivitetty 3/2024.
| Tieto | Nainen | Mies | Yhteensä |
|---|---|---|---|
| Suostumus voimassa | 42 843 | 27 279 | 70 122 |
| Kutsuttavissa | 39 075 | 24 182 | 63 275 |
Terveyteen liittyvät muut tiedot
Biopankin lisätietolomakkeella 2017 alkaen kerätyt näytteenantajan itseilmoittamat terveystiedot. Luvut suuntaa antavia, päivitetty 3/24.
| Tieto | Tieto saatavilla / näytteenantaja | Lisätiedot |
|---|---|---|
| Pituus | 67600 | itse ilmoitettu |
| Paino | 67300 | itse ilmoitettu |
| Tupakointi | 67700 | itse ilmoitettu |
Näyteaineisto
Näytteet on kerätty verenluovutuksen yhteydessä verenluovutuskriteerit täyttäviltä henkilöiltä. Näytteistä on saatavilla aikaleimat keräyksestä, käsittelystä ja pakastuksesta. Pitkittäisnäytteellä tarkoitetaan vähintään 2 näytettä eri aikapisteissä kerättynä samalta näytteenantajalta. Luvut suuntaa antavia, päivitetty 3/24.
| Näyte | Näytteenantaja | Pitkittäisnäyte |
|---|---|---|
| DNA | 65 000 | na |
| Plasma | 7 200 | 611 |
| Seerumi | 4300 | 66 |
| PBMC | 3 000 | 127 |
Saatavilla oleva data
Aineistossamme on saatavilla tietoa näytteenantajista ja näytteistä määritettyä tietoa. Näytteenantajista saatavilla olevia tietoja ovat mm. ikä, sukupuoli ja asuinpaikka. Lisäksi osasta näytteenantajista on saatavilla myös tarkempaa tietoa, kuten immunogeneettinen tieto tai genotyyppi. Saatavilla on myös näytteenantajan verenluovutushistoriatietoja, kuten veriryhmä, hemoglobiini, luovutusten lukumäärä ja luovutuskelpoisuus. Näytteistä määritetyt laboratorioanalyysit ovat myös tutkijan saatavilla (ks. alla). Tutkimushankkeista palautuva erikoisanalytiikkadata on hyödynnettävissä seuraavissa tutkimuksissa. Luvut suuntaa antavia, päivitetty 3/24.
| Tieto | Tieto saatavilla / näytteenantaja | Lisätiedot |
|---|---|---|
| Genotyyppi* | 45900 | |
| Immunogeneettinen tieto (klassinen HLA, KIR)* | 35400 | Imputoitu tieto |
| Immunogeneettinen tieto (non-klassinen HLA tieto)* | 500 | Kliinisen tason tieto |
| Immunogeneettinen tieto (MICA/MICB)* | 800 | Kliinisen tason tieto |
| Kliininen kemia* | 2500 | |
| Täydellinen verenkuva* | 3000 |
*HLA/ KIR
*Genotyyppi
Genotyyppidata on palautunut biopankkiin FinnGen- hankkeesta. FinnGen -hankkeen genotyypitys on tehty FinnGen ThermoFisher Axiom räätälöidyllä arraylla Thermo Fisherin genotyypityspalveluissa San Diegossa. Lisätietoa saat FinnGen-hankkeen sivuilta (englanniksi).
*Kliininen kemia
- peruskemian analyysit: S -ALAT, S-Lipidit, S-Gluk, S -Na, S -K, S -Krea, S –
AFOS, S -ASAT, S -Ca, S -Prot, S-Pi, S -Alb.
*Täydellinen verenkuva
- B-TVK: hemoglobiini (B-Hb), hematokriitti (B-Hkr), punasolujen määrä (B-Eryt), punasolujen keskitilavuus (E-MCV), punasolujen keskimääräinen hemoglobiinin määrä (E-MCH), trombosyytit (B-Tromb), leukosyytit (fB-Leuk), leukosyyttien erittelylaskenta (B-Diffi), neutrofiilit (B-Neut ja L-Neut% ), eosinofiilit (B-Eos Ja L-Eos%), basofiilit (B-Baso ja L-Baso%), monosyytit (B-Monos ja L-monos%), lymfosyytit (B-Ly ja L-Ly%), punasolujen kokojakauma E-RDW.
